微生物發(fā)酵法生產磷脂酰絲氨酸的菌株篩選:高產酵母的代謝通路改造
發(fā)表時間:2025-12-11磷脂酰絲氨酸(Phosphatidylserine, PS)是一種具有調節(jié)大腦功能、改善認知等生理活性的磷脂類物質,傳統(tǒng)提取法(從動物腦組織、大豆中提?。┐嬖谠鲜芟蕖⒓兌鹊?、成本高等問題。微生物發(fā)酵法以酵母為宿主菌合成磷脂酰絲氨酸,具有原料廉價、可規(guī)?;?、產物純度高的優(yōu)勢,其核心在于高產菌株的篩選與代謝通路的定向改造。以下從菌株篩選原則、酵母代謝通路基礎、改造策略及關鍵技術展開分析。
一、高產磷脂酰絲氨酸酵母菌株的篩選原則與初始菌株選擇
1. 篩選核心原則
酵母菌株需滿足自身磷脂合成能力強、遺傳操作可控、發(fā)酵耐受性好三大核心條件,具體篩選指標包括:
基礎磷脂酰絲氨酸產量:野生型酵母(如釀酒酵母)自身可合成磷脂酰絲氨酸,篩選天然的產量>5mg/L的菌株作為出發(fā)菌株;
生長特性:在廉價培養(yǎng)基(如葡萄糖、玉米漿培養(yǎng)基)中生長速率快,耐受高滲透壓、高溶氧環(huán)境,適合高密度發(fā)酵;
遺傳穩(wěn)定性:易于進行質粒轉化或基因組編輯,且改造后菌株的遺傳性狀穩(wěn)定,不易發(fā)生回復突變;
副產物少:發(fā)酵過程中不產生大量有機酸、乙醇等抑制性副產物,避免對磷脂合成的反饋抑制。
2. 常用初始菌株
釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae):食品安全級菌株(GRAS),磷脂合成通路研究最透徹,遺傳操作工具成熟,是生產食品級、醫(yī)藥級磷脂酰絲氨酸的首選宿主;
解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica):油脂和磷脂合成能力強,可利用多種碳源(如油脂、甘油),適合工業(yè)化高密度發(fā)酵;
畢赤酵母(Pichia pastoris):表達外源基因效率高,可分泌表達磷脂合成相關酶,減少胞內產物降解風險。
二、酵母合成磷脂酰絲氨酸的天然代謝通路基礎
酵母胞內磷脂酰絲氨酸的合成主要依賴磷脂酰膽堿(PC)-磷脂酰乙醇胺(PE)-PS轉化通路和CDP-二酰甘油(CDP-DAG)直接合成通路,兩條通路協(xié)同調控磷脂酰絲氨酸的積累:
CDP-DAG 直接合成通路(核心通路)該通路是酵母合成磷脂酰絲氨酸的主要途徑,反應步驟如下:
糖酵解產物磷酸二羥丙酮生成磷脂酸(PA),PA 在磷脂酸磷酸酶作用下生成二酰甘油(DAG);
DAG與CTP在CDP-DAG合成酶(Cds1p) 催化下生成CDP-DAG;
CDP-DAG與絲氨酸在磷脂酰絲氨酸合成酶(Pss1p) 催化下生成磷脂酰絲氨酸,該酶是此通路的限速酶,直接決定 PS 的合成速率。
PE-PS轉化通路(輔助通路)磷脂酰乙醇胺(PE)在磷脂酰絲氨酸脫羧酶(Psd1p/Psd2p) 作用下可反向生成磷脂酰絲氨酸(酵母中該反應可逆),但反應效率較低,需通過改造增強該通路的通量。
關鍵調控節(jié)點
限速酶Pss1p:受胞內磷脂酰絲氨酸濃度的反饋抑制,且其編碼基因PSS1的表達量較低,是通路改造的核心靶點;
輔因子供應:絲氨酸是合成磷脂酰絲氨酸的底物,胞內絲氨酸濃度不足會限制它的合成;CTP是CDP-DAG合成的能量底物,需保障其充足供應;
磷脂轉運:合成的磷脂酰絲氨酸主要積累在細胞膜上,需通過磷脂轉運蛋白(如Mss4p)將它轉運至胞內儲存,減少分泌流失。
三、高產酵母菌株的代謝通路改造策略
針對天然通路的限速步驟、底物供應、反饋抑制等瓶頸,采用基因工程編輯技術(如CRISPR-Cas9、同源重組)進行定向改造,核心策略包括以下4個方面:
1. 強化核心合成通路,解除限速酶抑制
過表達限速酶編碼基因將強啟動子(如釀酒酵母的TEF1啟動子、GPD啟動子)與PSS1基因融合,整合至酵母基因組,提升磷脂酰絲氨酸合成酶的表達量,直接提高磷脂酰絲氨酸合成速率。研究表明,過表達PSS1基因可使釀酒酵母的磷脂酰絲氨酸產量提升2~3倍。同時,過表達CDS1基因(編碼CDP-DAG合成酶),增加前體物CDP-DAG的供應,緩解底物限制。
解除限速酶的反饋抑制通過定點突變改造Pss1p的活性中心,降低其對產物磷脂酰絲氨酸的親和力,消除反饋抑制,例如,突變Pss1p的第156位丙氨酸為甘氨酸,可使酶活性提升40%,且不再受其濃度的抑制。
2. 優(yōu)化底物供應通路,保障前體與輔因子充足
強化絲氨酸合成通路絲氨酸是磷脂酰絲氨酸的直接底物,酵母中絲氨酸由3-磷酸甘油酸經3-磷酸甘油酸脫氫酶(Ser3p) 催化合成。過表達SER3基因,同時敲除絲氨酸降解基因 SHM1(編碼絲氨酸羥甲基轉移酶),可使胞內絲氨酸濃度提升50%以上,顯著促進磷脂酰絲氨酸合成。此外,在發(fā)酵培養(yǎng)基中添加廉價的L-絲氨酸(或其前體物甘氨酸),可進一步提升胞內底物濃度。
保障CTP輔因子供應CTP由UTP在CTP合成酶(Ura7p) 催化下生成,過表達URA7基因可增加CTP的合成量,為CDP-DAG的生成提供能量,避免因能量不足導致的通路停滯。
3. 阻斷競爭通路,減少碳流流失
酵母胞內的磷脂合成存在多條競爭通路(如合成PC、PE、磷脂酰肌醇等),這些通路會消耗共同前體物CDP-DAG,降低磷脂酰絲氨酸的碳流分配比例。
敲除競爭通路關鍵基因:敲除CHO1基因(編碼磷脂酰乙醇胺甲基轉移酶,催化PE合成PC),阻斷PC合成通路,使碳流更多流向磷脂酰絲氨酸合成;
弱化磷脂降解通路:敲除PLC1基因(編碼磷脂酶C,降解磷脂生成DAG),減少磷脂酰絲氨酸的降解,提升產物積累量。
4. 增強產物轉運與儲存,減少胞外分泌
合成的磷脂酰絲氨酸易結合在細胞膜上,過量積累會影響細胞膜的通透性和細胞生長,需通過改造磷脂轉運通路實現(xiàn)它的胞內儲存:
過表達磷脂轉運蛋白基因:過表達MSS4基因(編碼磷脂酰肌醇激酶,參與磷脂轉運),促進細胞膜上的磷脂酰絲氨酸轉運至胞內脂滴中儲存;
構建工程化脂滴:過表達脂滴形成相關基因(如ARE1、DGA1),增加胞內脂滴數(shù)量和體積,為磷脂酰絲氨酸提供儲存位點,避免產物對細胞的毒性。
四、菌株改造的關鍵技術與篩選驗證
1. 高效基因編輯技術
CRISPR-Cas9技術:精準敲除或插入目標基因,具有操作簡便、效率高的優(yōu)勢,適合多基因的協(xié)同改造;
同源重組技術:將外源基因(如強啟動子驅動的PSS1)整合至酵母基因組的特定位點(如非必需基因位點),保障基因表達的穩(wěn)定性;
質粒表達系統(tǒng):構建多拷貝表達質粒,實現(xiàn)多個通路基因的同時過表達,適合快速篩選最優(yōu)基因組合。
2. 高通量篩選與驗證方法
初篩:采用薄層層析(TLC) 快速檢測發(fā)酵液中的磷脂酰絲氨酸含量,篩選出其產量顯著提升的突變菌株;
復篩:通過高效液相色譜(HPLC) 精準定量磷脂酰絲氨酸的產量,同時檢測菌株的生長速率、底物利用率等指標,篩選綜合性能最優(yōu)的菌株;
穩(wěn)定性驗證:將目標菌株連續(xù)傳代10代以上,檢測每代的磷脂酰絲氨酸產量,篩選遺傳性狀穩(wěn)定的菌株。
五、 發(fā)酵工藝優(yōu)化與工業(yè)化應用潛力
代謝通路改造后的高產菌株需結合發(fā)酵工藝優(yōu)化,進一步提升磷脂酰絲氨酸的產量:
培養(yǎng)基優(yōu)化:優(yōu)化碳源(葡萄糖/甘油比例)、氮源(酵母膏/尿素)、無機鹽濃度,添加 L-絲氨酸、維生素B族等促進因子;
發(fā)酵參數(shù)調控:控制發(fā)酵溫度(28~30℃)、pH(5.5~6.0)、溶氧(DO>30%),采用分批補料發(fā)酵策略,避免葡萄糖過量導致的乙醇積累;
誘導表達調控:使用誘導型啟動子(如半乳糖誘導的GAL1啟動子)控制關鍵基因的表達,在菌株生長至對數(shù)期后誘導表達,減少基因過表達對細胞生長的負擔。
目前,經代謝通路改造的釀酒酵母菌株,在實驗室分批補料發(fā)酵條件下,磷脂酰絲氨酸產量可達500~800mg/L,部分工程菌株產量突破1g/L,具備工業(yè)化放大潛力。
微生物發(fā)酵法生產磷脂酰絲氨酸的核心是通過菌株篩選+代謝通路改造,實現(xiàn)酵母胞內磷脂酰絲氨酸合成的“開源、節(jié)流、穩(wěn)儲”。未來的研究方向將聚焦于:
挖掘新的高產酵母菌株(如極端環(huán)境酵母),拓展宿主菌的選擇范圍;
結合合成生物學技術,構建人工合成的磷脂酰絲氨酸合成通路,進一步提升碳流分配效率;
開發(fā)高效的產物分離提取工藝,降低下游純化成本,推動發(fā)酵法磷脂酰絲氨酸的產業(yè)化應用。
本文來源于理星(天津)生物科技有限公司官網 http://m.hntonghetang.com/
EN




